Üçüncü film, Men in Black, məşhur Amerika komediyasının davamıdır. Baş rolları eyni Tommy Lee Jones və Will Smith oynadı. Rejissor yenidən Steven Spielberqin arxasında icraçı prodüser Barry Sonnenfeld tərəfindən götürüldü. Film kinoteatrlarda 23 May 2012-ci ildə başlamışdır.
Bu dəfə mənfi qəhrəmanın rolunu Jemaine Clement alır, Boris rolunu oynayır. Bu, Ay Həbsxanasından qaçan cinayətkardır. 1969-cu ilin iyul ayında günahkarı tutaraq qolsuz qoyan Agent Kay-a nifrət hissi ilə yanır. Kay birdən Borisin qaçdığını biləndə, tutulduğu zaman onu öldürmədiyinə görə böyük təəssüf hissi keçirir. Bundan sonra agent sadəcə yox olur və yalnız ortağı Jay var olduğunu xatırlayır. Qara geyimli işçilərin qalan hissəsi, Kayın 1969-cu ildə bir cinayətkarla qarşıdurmada öldüyünü düşünür.
Reallığın belə bir şəkildə geri çevrilməsinin yeganə izahı keçmişdəki dəyişiklikdir. Jay və Agent O, Borisin iştirak etdiyinə qərar verir. Bunu kosmik miqyaslı başqa bir hadisə - Boris irqinin Yer kürəsini işğalı təsdiqləyir. Keçmiş gerçəklikdə, Kay planetdə "ArkNet" adlı bir qoruyucu cihaz qurduğu üçün bu mümkün deyildi. İndi agentin ölümü ilə əlaqədar olaraq, on illər əvvəl Yerin kosmik düşmənləri qarşısında heç bir maneəsi yox idi.
Jay, Borisin silahlanmasında qanunsuz bir zaman dəyişikliyi edən bir elektronik satıcısı Jeffrey Price tərəfindən keçmişə göndərildiyini kəşf edir. Agentin ortağını xilas etmək üçün keçmişə səyahət etməkdən başqa yolu yoxdur. Və dərhal gənc Kay tərəfindən həbs olunur. Dindirmə zamanı Jay ona hər şeyi danışır və gələcək tərəfdaş inanır. Birlikdə ArkNet-i olan Arkanian Griffini tapırlar. İndi üçü də səyahətlərinə davam edir və aya qorunma qurmaq üçün yola çıxırlar. Ancaq bir raketdə polkovnik tərəfindən həbs olunurlar. İndi Jay'in gizli qapıçısı oldu.
Bu andan etibarən hadisələr sürətlə inkişaf edir. Qəhrəmanlar iki Borislə görüşür və dava olur. Gələcəkdən bir cinayətkar raket şaftına atılır və cavan Boris onun ardınca göndərilir. Yer kürəsi üçün qoruma quruldu. İndi isə, Jay'nin missiyası başa çatmış kimi görünsə də, möcüzəvi şəkildə sağ qalan bir gənc cinayətkar meydana çıxır. Polkovnik öldü, ancaq Boris də məhv edildi. İndi də filmdə yeni bir personaj meydana çıxır. Polkovnikin maşınından bir oğlan düşür və atasını axtarmağa başlayır. Agent özünü tanıyır. Jay vaxtına qayıdır və Kay ilə kafedə tanış olur. Hər şey geri qayıtdı.
